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PathMiner 病理图像处理软件

  • 软著登记号：2026SR0985162

PathMiner

全面的病理图像处理软件

PathMiner 是一款病理图像处理软件，适配 HE、免疫组化、多重荧光、原位杂交、组织芯片及特殊染色等数字病理切片。软件集成多种图像处理模块，预置多套 AI 模型，可完成组织分型、面积定量、细胞标志物定量及空间分布分析。界面直观，支持快速响应和高通量处理，输出从单细胞到全切片的定量结果。PathMiner 面向基础研究与转化研究中的图像分析需求，为药企、生物技术企业及医疗科研机构提供支持。

直观简洁，快速上手

  • 模块化、向导式操作，无需从头构建算法。灵活圈注工具支持ROI绘制、修改、复制粘贴等，组织识别模块可自动识别组织区域。算法调整简单，在保证数据质量的同时降低使用门槛。

分析全流程智能驱动

  • 内置预训练模型，自动识别肿瘤区域、三级淋巴结构等复杂结构。自动完成组织分型，无需手动勾勒，组织芯片可全自动分割。原生支持 OME-TIFF、SVS、NDPI 等大切片，多线程并行处理。

像素级精准定量结果

  • 卷积神经网络精准分割免疫组化、多重荧光图像，量化表达强度。大规模数据训练的 AI 算法结果高度可重复，避免人为误差。提供逐个细胞形态与标志物强度数据，结果可追溯、可验证。

轻松挖掘海量数据

  • 轻松完成1000+蛋白空间组学数据并行批量分析。内置筛选、可视化工具，从数百万细胞中快速定位目标群体，深度挖掘生物学意义，支撑科研与转化应用。

图像格式

兼容主流数字病理扫描仪

PathMiner 可以读取主流数字病理扫描仪生成的图像，不必先把切片转成另一种格式。

ZYP SCN SVS LIF SDPC DICOM MRXS VSI QP.TIFF NDPI / NDPIS CZI KFB / KFBF 标准格式：TIF、OME-TIFF、JPG、PNG

功能总览

先看全部模块，再逐项展开

基础功能模块

随软件提供

  1. HE 细胞定量
  2. 免疫组化定量
  3. 免疫组化膜定量
  4. 荧光细胞定量
  5. 区域分割
  6. 目标物定量
  7. 面积定量
  8. 空泡定量
  9. 空间关系分析
  10. TMA 分析

可选功能模块

按需开通

  1. 图像配准
  2. 肿瘤出芽识别
  3. 明场三级淋巴结构识别
  4. 荧光三级淋巴结构识别
  5. 肾小球分析
  6. 神经细胞定量
  7. FISH 定量分析
  8. 脑图配准分析
  9. AI 自训练
  10. 数据统计分析

辅助工具

各模块通用

  1. 灵活的标注工具
  2. ROI 跨图像复制
  3. 组织自动识别
  4. 染色自动拆分
  5. 同屏查看
  6. 导出标志物组合表型
  7. 导出截图与 OME-TIFF

基础功能模块

定量、分割与空间分析

01 / 10

HE 细胞定量

基于预训练的 AI 模型，自动分割 HE 图像中的细胞核，得到每个细胞核的轮廓并统计数量。结合肿瘤区域分割后，可以把细胞分为淋巴细胞、肿瘤细胞和其他细胞。

HE 细胞定量

可选功能模块

配准、特殊结构与自训练

01 / 10

图像配准

支持 HE、免疫组化、多重荧光切片的刚性与非刚性配准，自动批量对齐循环染色与连续切片，校正形变和旋转，并衔接定量、共表达与空间分析。多张免疫组化连续切片可以融合成一张伪多重荧光图像。

图像配准

辅助工具

标注、查看与导出

01 / 07

灵活的标注工具

多种标注工具可选，按需要绘制感兴趣区域（ROI），并可命名、缩放、旋转。

灵活的标注工具

多重荧光分析流程

从组织分型到数据挖掘，支持超过 100G 的图像

01
组织分型

组织分型

按细胞角蛋白等肿瘤标志物，自动分割肿瘤区域。

02
细胞识别

细胞识别

自动分割 DAPI 细胞核。

03
表型分析

表型分析

按染色强度定量，得到各种标志物组合的细胞。

04
数据挖掘

数据挖掘

查看热点、类流式图、相关性、空间关系、表达强度和 t-SNE。

01 / 06

热点区域呈现

把高密度的表型细胞汇成热点，在全片上直接看到聚集位置。

热点区域呈现

产品特点

为什么选择 PathMiner

丰富的功能 预训练 AI 模型 高度自动化 国产自研 高性价比 优质支持服务